转录调控元件分析，论述转录后调控的方式
chanong
|9月9日，国际期刊《细胞死亡疾病》发表中国科学院生物物理研究所韦涛涛课题组与美国克赖顿大学涂亚平课题组的联合论文。 ——韦涛涛课题组与涂亚平课题组合作时期的又一成果。研究人员发现miR-133a表达上调促进线粒体生物发生和肌细胞分化，并进一步发现通过“定向染色质结构捕获”（CAPTURE）技术上调miR-133a表达发现了KAP1因子，加深了对转录调控的认识。 miR-133a的调控机制和重要功能。
MicroRNA（miRNA）在多种生理和病理生理过程中发挥着重要的调节作用。在前期研究中，魏涛涛课题组与涂亚平课题组密切合作，证明TGF-1诱导的miR-133a表达可能对TGF-1受体和TGF-1受体产生负面影响，我们已经通过分子、细胞和动物实验。反馈控制。其效应分子负向调节TGF-1信号通路，从而抑制或部分逆转特发性肺纤维化（IPF）的进程。相关论文于2019年9月11日发表在《细胞死亡饮食》杂志上。
考虑到miR-133a的重要生理和病理生理功能，阐明其调控机制将为肺纤维化及其他相关疾病的治疗提供重要线索。魏涛涛课题组和涂亚平课题组进一步以成肌细胞分化过程中miR-133a的动态表达为模型，将基于CRISPR/Cas9的CAPTURE技术应用于高通量测序和生物信息学结合分析，对miR-133a进行系统研究-133a。 133a.考察133a的表达调控机制，我们发现KAP1相关的转录调控复合物可以抑制C2C12成肌细胞中miR-133a的表达，敲低KAP1会增加miR-133a的表达，并且这个过程涉及线粒体生物发生和C2C12 成肌细胞的分化；miR-133a 的上调足以诱导C2C12 成肌细胞的线粒体生物发生和分化，而miR-133a 的抑制剂显着抑制细胞分化。
在本研究中，我们首次利用CAPTURE技术鉴定了细胞分化过程中调控miR-133a表达的关键因素，为理解microRNA的精准调控机制提供了新思路。
魏涛课题组博士生张吉岭为该论文的第一作者，魏涛和涂亚平为该论文的通讯作者。该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金委、生物高分子国家重点研究院的资助。
图1.“定向染色质结构捕获”技术用于富集与miR-133a 基因上游调控区结合的调控蛋白。质谱鉴定表明，KAP1 和其他转录抑制因子可以与miR-133a 基因的上游区域结合。 133a 基因(A)；KAP1 过表达下调miR-1/133a 表达，而KAP1 敲低则促进miR-1/133a 表达(B)。
图2. miR-133a 显着增加线粒体膜电位(A)，并通过PGC-1/Nrf1 途径上调多个线粒体电子传递复合物亚基的表达(B)，从而导致线粒体增强氧化磷酸化(C)。