polq基因，svp基因
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|近日，在《科学报告》（科学报道）上，上海辰山植物科学研究所植物逆境耐受与分子进化研究组通过计算机模拟预测MAPK和PP2C的蛋白质-蛋白质相互作用网络，揭示了新的对接位点。已在线发布。中国科学院中心二穗短柄草突变体研究论文。本研究预测了短柄草MAPK与PP2C基因家族成员之间的蛋白质相互作用网络，并根据相互作用结构总结了两个短柄草基因家族相互作用成员之间的锚点。 PP2C基因家族在MAPK信号通路中发挥负调控作用。建立两个基因家族成员之间的相互作用网络对于研究多种胁迫下MAPK信号通路的作用机制具有重要意义。在本研究中，我们基于能量值越小，相互作用形成的复合物越稳定的原理，在计算机上预测了PP2C和MAPK的三级结构，并基于同源映射，确定了它们的最小能量值选择交互作为交互网络的阈值。先前在酵母、拟南芥和人类中的实验研究表明，与MAPK 相互作用的蛋白质，包括底物、调节蛋白、抑制蛋白和支架蛋白，都在其N 端非催化区域中含有典型的保守基序。 R/K1-3-X1-6--X-，其中是疏水残基）锚定位点（D位点）和包含IYT基序或DEF基序的非典型锚定位点。本研究预测的二穗短柄草MAPK 和PP2C 家族的相互作用成员还包括先前实验结果中报道的典型和非典型锚定位点。此外，进一步分析表明，BdPP2C 蛋白上存在一个新的二穗短柄草特异性锚定位点，可与BdMAPK 相互作用。该论文主要由硕士生牛超和科研助理蒋敏撰写，通讯作者为褚兆庆研究员。该研究工作得到了中国科学院STS遗传资源创新项目（zszc-013）和上海市绿化与城市市容管理项目（G162406和G162407）的支持。
预测的BdPP2C和BdMPK蛋白相互作用网络及其锚定位点模式图