猴痘病毒是什么病毒，猴痘病毒和猴b病毒的关系

澎湃新闻记者森宁

截至5月21日，葡萄牙、比利时和美国的三个研究小组公布了近期全球各地暴发的猴痘感染者所携带病毒基因组序列的初步结果。三种猴痘病毒（MPXV）的DNA序列初步显示出同源性，均属于温和的西非毒株，与2018年和2019年在英国、新加坡和以色列发现的猴痘病毒密切相关。

世界卫生组织此前曾表示，猴痘病毒有两个主要分支：西非分支和刚果盆地分支。西非分支死亡率较低，感染相关死亡率约为1%，而刚果盆地分支死亡率可高达10%。

据世界卫生组织最新统计，截至5月21日，已有129个无猴痘国家向世卫组织报告129例确诊猴痘病例和28例疑似猴痘病例，全球疑似猴痘病例持续增加。预计猴痘病例还会继续出现。增加。

猴痘通常以流感样症状和淋巴结肿大开始，症状通常与天花相似，但比天花轻。早期症状包括发烧、肌肉疼痛、发冷和疲劳。更严重的情况下，面部和生殖器上经常出现类似水痘或天花的皮疹。全身出现疼痛、发痒的病变，最终结痂、脱落。

感染猴痘的人通常在感染后7 至14 天开始出现症状，症状通常持续数周。世界卫生组织和美国疾病控制与预防中心宣布，“大多数人都能从病毒中康复，但在某些情况下，它可能是危险和致命的”。

当地时间5月19日，葡萄牙国立卫生研究院的若昂·保罗·戈麦斯及其同事在其网站（https://virological.org）上发表了他们的团队于5月4日对患者进行的研究论文。来自葡萄牙的男性患者（PT0001）。这也是近期世界多地爆发猴痘疫情以来首个现代猴痘病毒基因组测序结果。

研究团队使用QIAamp DNA 血液试剂盒（Qiagen）从患者皮肤渗出液样本中提取猴痘病毒DNA，并使用快速条形码测序试剂盒（SQK-RBK004）在Oxford Nanopore MinION 平台上测试病毒。基因组。测序。整个基因组的平均覆盖深度约为7 倍。 （覆盖深度，也称为测序深度，是指每个碱基被测序的平均次数，或者说是测序数据总量与基因组大小的比值。）接下来，团队利用INSaFLU在线平台给我使用了它来做映射。我们将多个短基因片段（reads）添加到相关参考基因组序列（MN648051.1）中，并手动检查基因组序列以确认变异的位置。已发表的基因组序列草案覆盖了参考序列的92%。

图1：葡萄牙团队发表的基因进化树分析草案基于52个猴痘病毒基因序列的核心比对（955个突变位点与137,668 bp长的基因序列比对）

该论文称，基因树分析草稿显示，分离出的病毒与2018 年和2019 年从尼日利亚传播到英国、以色列和新加坡的病毒密切相关。作者表示，一旦获得更深入的Illumina 数据（测序仍在进行中），将提供进一步的病毒基因组序列。

截至5月19日，葡萄牙已确诊20多例猴痘病例，相关研究人员已开始对部分病毒样本的基因组进行测序。 “随着更多病毒基因组的测序，数据和分析将继续更新。这对于了解当前流行病毒的起源和国际传播至关重要。”是的，”该研究的作者说。

比利时的样本报告于当地时间5月20日发布。比利时安特卫普大学研究人员发表了该国猴痘患者病毒基因测序报告（www.virological.org）。比利时男子30岁，曾居住在里斯本。是的，葡萄牙自5月13日以来，他因肛周丘疹和双侧腹股沟淋巴结疼痛性肿胀而到ITM 性传播疾病诊所就诊。他的伴侣后来出现了类似的症状。对病灶样本的初步调查显示，单纯疱疹病毒和梅毒螺旋体呈阴性，猴痘病毒呈阳性。

随后，研究人员在Oxford Nanopore的minION平台上使用非靶向宏基因组方法获得了猴痘病毒的全基因组序列数据，以18.9x的平均测序深度重建了98.9%的基因组。

图2：比利时团队提出的猴痘病毒遗传进化树。

通过快速比较新测序的基因组的蛋白质编码区核心区域与之前公布的基因组的核心区域，研究人员发现比利时猴痘病毒基因组（ITM_MPX_1）也是猴痘病毒的成员。西非分支，疫情基因组与最近上传的葡萄牙猴痘病毒基因组相似，且相关性最为密切，为欧洲发生大量社区传播提供了进一步证据。

美国研究人员发布了第三份猴痘病毒基因组测序报告（MA001）。当地时间5月20日，美国研究团队公布了马萨诸塞州5月18日确诊的一名猴痘患者携带的病毒基因序列。目前的数据结果仅在国家医学图书馆数据库中公开提供。