正常菌群的免疫作用，菌群的重要性

9月22日的《热心肠日报》重点对儿童、过敏、IBD、饮食、噬菌体、COVID-19、生物传感器、粘膜免疫、乳糜泻、粪便细菌移植等九份文件进行了解读。

Nature Reviews：儿童早期微生物群的发育和过敏风险（综述） Nature ReviewsImmunology——[40.358] 分娩方式、抗生素使用、母乳喂养和病毒感染等因素影响儿童微生物群的定植 宿主微生物群的变化可能会影响诱导Tregs，直接调节IgA和Tp型免疫反应的产生，或通过产生短链脂肪酸的代谢；还受到暴露于环境微生物以及影响免疫系统发育的各种机制的控制，包括控制病毒、真菌对免疫系统的影响不可忽视；益生菌/益生元干预、预防呼吸道感染、早期接触食物、摄入水解奶粉等具有调节菌群、预防过敏的作用。 [编者评]

现代生活方式可以直接或间接影响微生物组（包括细菌、病毒和真菌），微生物组在塑造宿主的免疫反应中发挥着主导作用。儿童时期是菌群发育的窗口期，也是有效预防过敏性疾病的重要时期。 《自然评论免疫学》发表的一篇综述文章探讨了各种过敏性疾病危险因素（包括剖腹产、抗生素暴露、缺乏母乳喂养和病毒感染）对儿童早期细菌定植和免疫系统发育的影响。描述调节微生物组。 (@szx) 【原始信息】

儿童期微生物接触和过敏风险： 预防机会

2020-09-11, doi: 10.1038/s41577-020-00420-y

Nature Reviews：一篇论文了解溃疡性结肠炎（综述） Nature Reviews Disaster Primers——[40.689]UC发病率因地区而异，但不受种族影响，多种遗传/环境因素影响UC的风险；UC的发病机制：细菌菌群失调导致结肠粘液层损伤，促进细菌易位，激活巨噬细胞和其他APC，诱导趋化性。 5-ASA、类固醇、生物制剂（针对TNF、IL-12/23、整合素）、JAK抑制剂、手术治疗有效。根据病程采用适当的治疗方法和其他治疗方法，并注意改善患者的肠外症状和生活质量。 [编者评]

Nature Reviews Disaster Primers 发表的一篇综述文章详细介绍了溃疡性结肠炎(UC) 的流行病学、危险因素、病因、诊断/筛查/预防、药物、手术以及其他治疗和管理方法。未来的研究方向，包括机制研究，是讨论过。治疗靶点的变化、新药开发和个性化医疗。 (@szx) 【原始信息】

溃疡性结肠炎（《自然评论疾病入门》）

2020-09-10, doi: 10.1038/s41572-020-0205-x

细胞子刊：饮食成分及其代谢如何调节免疫力（综述）免疫——[22.553]负能量平衡（摄入和支出）促进代谢重编程（脂肪酸氧化和糖酵解），调节免疫反应等生理过程，从而促进肥胖引起的能量失衡，导致脂肪组织中促炎性免疫细胞浸润和NLRP3炎症小体激活，导致2型炎症小体激活，促进糖尿病、心血管疾病、癌症等的发生，降低免疫力对抗病原体。必需氨基酸限制诱导硫转移途径和整合应激反应，抑制NLRP3炎性体介导的炎症和Th17反应；热量限制减少循环免疫细胞，降低全身炎症反应。 [编者评]

综合免疫代谢反应（IIMR）将食物摄入、能量利用和储存与免疫反应调节联系起来，对于维持和恢复体内平衡很重要。 《Immunity》发表的一篇综述文章，重点关注了葡萄糖、脂肪、蛋白质等膳食成分的变化如何影响免疫系统，并探讨了膳食常量营养素摄入和代谢与免疫系统的关系，并对这种关系进行了详细解释。脂肪组织。 (@szx) 【原始信息】

饮食免疫调节

2020-09-15, doi: 10.1016/j.immuni.2020.08.013

1篇论文了解噬菌体-细菌-宿主相互作用（综述）细胞和分子免疫学——[8.484]噬菌体可以在细菌内经历裂解和溶原循环细菌使用CRISPR-Cas系统噬菌体通过溶原转化来保护免受噬菌体的侵害，并可以改变感染性。 噬菌体通过巨噬细胞抑制细菌的吞噬作用和炎症因子的产生，通过激活树突状细胞和ILC来抑制细菌的吞噬作用产生IFN，并以多种方式与宿主肠道免疫系统相互作用，包括直接抑制定植。等；遗传因素、饮食、出生方式、年龄等因素都会影响噬菌体的组成；噬菌体疗法可用于治疗多重耐药细菌感染、对微生物群进行靶向控制和调节，在免疫方面具有巨大的潜在应用前景。功能。 [编者评]

噬菌体被认为有可能成为耐药细菌感染的自然疗法，但由于性质和机制尚不清楚，其应用受到限制。测序技术的进步促进了对噬菌体攻击和消灭细菌的裂解和溶原机制的理解。 《细胞与分子免疫学》发表的一篇综述文章详细介绍了噬菌体-细菌-宿主免疫系统相互作用的机制，以及噬菌体在靶向微生物群治疗和免疫调节领域的巨大潜在应用，令人期待。对噬菌体-细菌-宿主相互作用的彻底研究将有助于更好地利用噬菌体治疗各种感染性或非感染性疾病。 (@szx) 【原始信息】

噬菌体及其调节微生物组和免疫的潜力

2020-09-08，doi: 10.1038/s41423-020-00532-4

肥胖和糖尿病加重新型冠状病毒感染的机制（综述）eLife——[7.08] ACE2在肥胖/糖尿病患者的各种组织（包括脂肪组织）中高表达，ADAM17（在肥胖/糖尿病患者中高表达）。肾素-血管紧张素系统（RAS）造成调节失调。感染可损害血管内皮功能，进一步促进细菌易位；循环LPS增加导致肺内内毒素蓄积病毒与LPS相互作用可能导致促炎因子颗粒表达，从而上调和稳定病毒稳定性，增加病毒感染性。 [编者评]

肥胖和糖尿病是COVID-19的合并症，患有肥胖/糖尿病的COVID-19患者可能会出现更严重的症状。 《eLife》发表的一篇评论文章详细介绍了肥胖和糖尿病恶化COVID-19 感染的潜在机制。这些包括患者脂肪组织中ACE2 的高表达、肺部ACE2 的脱落和积聚以及SARS-CoV-2 感染促进感染。肠道细菌转移到循环系统以及细菌和病毒之间的相互作用增加了病毒的传染性。 (@szx) 【原始信息】

肥胖和糖尿病作为COVID-19: 的合并症。病毒-细菌相互作用的潜在机制和作用。

2020-09-15, doi: 10.7554/eLife.61330

实时诊断肠道炎症的新工具生物传感器和生物电子学——[10.257]硝酸盐是肠道炎症的生物标志物；利用大肠杆菌NarX-NarL双组分调控系统构建硝酸盐响应基因回路。肠道厌氧条件下；利用灵敏度和特异性优化硝酸盐生物传感器，引入益生菌大肠杆菌Nissle1917；在具有天然肠道菌群的小鼠肠道中测试生物传感器，在炎症过程中检测到硝酸盐水平升高；布尔AND门用于生成基因编码的生物传感器，可以同时检测硫代硫酸盐和硝酸盐生物标志物，提高监测肠道炎症工具的特异性。 [编者评]

Biosensors and Bio electronics 最近发表的一篇论文开发了一种全细胞生物传感器，利用硝酸盐响应基因电路传感来实时诊断肠道炎症。这可能为炎症相关疾病的无创诊断提供新的方法。 （@Love's Choice）【原创留言】

全细胞生物传感器设计用于通过硝酸盐传感实时诊断肠道炎症

2020-08-20，doi: 10.1016/j.bios.2020.112523

Nature子刊：瞬时菌群耗竭可能增强粘膜免疫Nature Communications——[12.121] TMDI降低小鼠肠道菌群的定植抵抗力，扩大肠道内的口服Lm 重复抗生素治疗可增强TMDI的效果，进一步促进抗原特异性的产生CD8+ Trms；由于抗原负载量高，可增强肠道内抗原特异性CD8+ Trms的扩增；从机理上讲，TMDI穿过CXCL9/CXCL10-CXCR3轴，促进CD8+ T细胞向肠道迁移； Lm 30天口服给药后，再次给予小鼠高剂量的Lm，TMDI可激活T细胞亚群如CD8+T细胞、CD4+T细胞、T细胞的反应。用于组织保护。 [编者评]

肠道中的CD8+ 组织驻留记忆T 细胞(Trm) 在遇到抗原后会迅速重新激活，并为粘膜表面提供免疫保护，但增强Trm 反应的机制仍有待阐明。我发现，最近发表在《自然通讯》上的一项研究表明，瞬时微生物群消除增强免疫（TMDI）可以抑制单核细胞增生李斯特菌（Lm）免疫小鼠的肠道微生物群生长。定植抗性促进Lm在肠道内的扩张，从而增强抗原细菌的增殖。特定的CD8+ Trm 反应可在随后的二次免疫中保护组织。 TMDI 可用作研究肠道Trm 反应的工具或作为设计新型粘膜疫苗的研究平台。 (@szx) 【原始信息】

通过暂时消除微生物群来增强粘膜免疫力

2020-09-08, doi: 10.1038/s41467-020-18248-4

环境危险因素对乳糜泻高危婴儿肠道微生物群发育的影响。我们研究了肠道微生物群的组成、功能和代谢。 剖腹产与普通拟杆菌和多雷拟杆菌丰度减少、叶酸生物合成途径丰度减少、羟苯乙酸丰度增加有关，这些变化可能导致免疫系统缺陷。具有平衡和炎症。在存在环境危险因素（剖腹产、非母乳喂养、抗生素暴露）的婴儿中，单形拟杆菌和3-3-羟苯基丙酸的量随着时间的推移而增加，而硫辛酸和甲烷的代谢途径则随着时间的推移而减少。上述变化与免疫调节和抗炎作用有关。 [编者评]

遗传易感性和接触麸质是乳糜泻的必要条件，但不是充分条件，生命早期接触其他环境因素可能在乳糜泻的发展中发挥重要作用。最近发表在Microbiome 上的一项研究使用多组学分析来评估环境风险因素（剖腹产、配方奶喂养、抗生素（例如接触）。由于疾病的影响，剖腹产与免疫调节和抗炎相关的微生物群变化有关，而未暴露于环境危险因素则与免疫调节和抗炎相关的微生物群变化有关。 (@szx) 【原始信息】

多组学分析揭示遗传和环境风险因素对有乳糜泻风险的婴儿肠道微生物群发育的影响

2020-09-11, doi: 10.1186/s40168-020-00906-w

微生物代谢产物在粪便移植治疗复发性艰难梭菌感染中的作用肠杆菌科细菌——[7.74]牛磺胆酸促进艰难梭菌萌发，在rCDI患者粪便中含量丰富；次级胆汁酸可抑制艰难梭菌生长。营养微生物。艰难梭菌的增殖和毒性；FMT可使rCDI患者粪便中次级胆汁酸水平升高，恢复胆汁酸代谢酶的功能，激活法尼醇X受体通路；rCDI患者粪便中SCFA水平下降， FMT干预后恢复，SCFA可以调节肠道屏障功能，抑制炎症；FMT后，细菌代谢物三甲胺和氧化三甲胺虽然有所增加，但这可能与患者菌群恢复和供体饮食有关，或者供体可以根据三甲胺和三甲胺氧化物的含量进行选择。 [编者评]

粪便微生物移植（FMT）是治疗复发性艰难梭菌感染（rCDI）的有效方法，但FMT的作用机制仍不清楚。 《Gut Microbes》上发表的附录描述了粪便细菌移植在调节肠道微生物代谢物（包括胆汁酸和短链脂肪酸(SCFA)）治疗rCDI 中的机制和效果。我正在解释。其他细菌代谢物的潜在影响，包括三甲胺和三甲胺氧化物。 (@szx) 【原始信息】

了解粪便微生物群移植治疗复发性艰难梭菌感染的有效性机制，以及肠道微生物衍生代谢物的贡献：

2020-09-06, doi: 10.1080/19490976.2020.1810531 感谢本日报的作者：CURE、Good Rain、szx、orchid、Echo Quasimodo 点击查看近10天的日报：09-21 | 可以吃饭少糖真的能防癌吗？超10万人数据揭晓答案09-20 | 早睡早起好处多：“百灵鸟”型对健康食品更感兴趣09-19 | 1667对母子分析：哪些微生物或因素可以让孩子超重/过敏09-18 | 当今科学进展：饮食如何调节“肠肾轴” 09-17 | 了解必做1篇文章+1张照片：肠道菌群在代谢健康中的重要作用09-16 | 港澳专家重点发现：嗜热菌或可抑制大肠癌09-15 | 30分回顾详解：炎症性肠病男女有何不同？ 09-14 | 微生物群与癌症有何关系？近期值得一读的3条评论09-13 | 什么是膳食多胺？对健康有何影响？09-12 | 肠道衰竭后会发生肠道再生吗？《自然·医学》 报告主要进展